Геномный центр ReadSense создает биобанк наследственных раков
В июле контрактная генетическая лаборатория ReadSence, входящая в группу компаний «ТехноСпарк» стала основной лабораторией российского фундаментального проекта OncoBRCA, изучающем генетику наследственных раков. Проект поддержан российским исследовательским биобанком «Национальный биосервис». Учредителем «ТехноСпарка» является Фонд инфраструктурных и образовательных программ.
OncoBRCA анализирует широкий спектр наследственных раков: рак молочной железы, рак яичников, колоректальный рак, рак эндометрия, нейроэндокринные опухоли, рак пищевода и других. Специализированный банк данных формируется на основе уникальных клинических выборок, характеризуемых с использованием методов таргетного секвенирования. Деперсонализованный биоматериал для проекта OncoBRCA предоставляют более 50 российских клиник, координируют проект сотрудники Республиканского Онкологического Диспансера Республики Татарстан под руководством онколога Марата Гордиева. С 2013 года собрана информация более чем 2000 образцов.
Контрактная лаборатория ReadSense осуществляет подготовку полученного биологического материала и таргетное секвенирование образцов.
«Биологический материал проходит стадии выделения ДНК, синтеза библиотек и обогащения целевыми фрагментами генов, ассоциированными с наследственными формами рака. Далее образцы проходят этап секвенирования нового поколения (NGS) с использованием платформы Illumina. В итоге мы получаем файлы прочтения последовательностей интересующих нас участков генома, которые анализируются с использованием специальных алгоритмов биоинформатической обработки данных. Результат „расшифровки“ ДНК помещается в созданную базу данных клинически значимых вариантов. Лабораторная стадия процесса занимает около недели и требует высокой квалификации сотрудников лаборатории, так как от качества пробоподготовки и секвенирования напрямую зависит качество и полнота получаемых данных исследования», — рассказал руководитель контрактной лаборатории ReadSense Глеб Спешилов.
Еженедельно ReadSense расшифровывает для OncoBRCA более 50 образцов, после чего массив данных отдается заказчику.
Контрактная лаборатория ReadSense специализируется на выполнении сложных контрактных работ по целевому анализу панелей генов с использованием высокопроизводительного секвенирования 2 и 3 поколений.
